Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED13Q9UHV7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms