Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH3Q9UHC1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms