Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5BQ9UGL1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms