Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM8A1Q9UBU6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms