Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRBP1Q9P2E9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms