Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CCDC180Q9P1Z9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms