Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKDREJQ9NTG1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms