Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms