Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRHQ9HD43 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms