Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1Q9H875 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms