Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms