Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP1Q9C000 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms