Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms