Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS2Q9BXC9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS2Q9BXC9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms