Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms