Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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