Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PLIN4Q96Q06 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms