Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP3Q96P20 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms