Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD4Q96M96 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms