Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms