Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms