Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMTM5Q96DZ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms