Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUB2Q96DC9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms