Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTI1AQ96AJ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTI1AQ96AJ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms