Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RABGGTAQ92696 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RABGGTAQ92696 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RABGGTAQ92696 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RABGGTAQ92696 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RABGGTAQ92696 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RABGGTAQ92696 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RABGGTAQ92696 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RABGGTAQ92696 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RABGGTAQ92696 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RABGGTAQ92696 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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