Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHF3Q92576 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms