Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTTNBP2Q8WZ74 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms