Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF3Q8TEJ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms