Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms