Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms