Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HJURPQ8NCD3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms