Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LTBP4Q8N2S1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP4Q8N2S1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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