Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4Q8IY92 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4Q8IY92 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms