Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms