Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNDC1Q76NI1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNDC1Q76NI1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms