Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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