Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEM1Q6ZVN7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms