Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms