Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms