Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC9A4Q6AI14 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms