Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms