Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms