Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSP90AB3PQ58FF7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB3PQ58FF7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms