Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms