Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCGF3Q3KNV8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms