Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSPP1Q1MSJ5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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