Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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