Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF239Q16600 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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