Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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