Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDB1Q16531 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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